이재명 대통령은 4일 수석보좌관 회의에서 '투표용지 부족 사태'와 관련하여 민주공화국 선거 관리에 납득하기 어려운 허점이 드러난 점에 대해 큰 유감을 표명했다. 대통령은 모든 국가기관이 국민의 참정권 행사 과정에서 빈틈이 없도록 만반의 준비를 해야 할 책무가 있음을 강조하며, 투표용지 부족으로 인해 일부 지역에서 투표를 하지 못하고 돌아가거나 대기하는 사태에 대해 중앙선거관리위원회(중앙선관위)를 질타했다. 또한 관계기관은 행정부의 책임과 권한을 사용하여 문제 발생 이유를 명확히 밝히고 책임을 물어야 하며, 참정권 훼손이 재발하지 않도록 신뢰할 만한 대책을 마련할 것을 요구했다. 이에 대해 강유정 수석대변인은 이는 선관위에 대한 직접 제재가 아닌, 선관위가 책임 있는 조치를 다하여 참정권이 흔들리지 않도록 해야 한다는 의미라고 설명했다. 여야는 중앙선관위를 강하게 비판했다. 더불어민주당 조승래 총괄선대본부장은 선관위 행정을 책임지는 사무총장의 거취까지 고민해야 한다고 지적했다. 국민의힘 송언석 원내대표는 긴급 국정조사를 요구하고 허철훈 중앙선관위 사무총장과 오민석 서울시선관위원장의 사퇴를 촉구했다. 국민의힘 오세훈 서울시장 당선자는 결과적으로 모두 대통령의 책임이라고 지적하며 선관위를 해체하고 근본부터 혁신해야 한다는 입장을 밝혔다. 한편, 중앙선관위는 입장문을 통해 외부 전문가 위주로 구성된 진상규명위원회를 설치·운영하여 문제점과 원인, 책임을 철저히 따져 국민에게 결과를 밝히겠다고 밝혔다.